SyBIT – le projet de bioinformatique de SystemsX.ch

Partie intégrante de l'Initiative Suisse de Biologie des Systèmes, SystemsX.ch, le service central «SyBIT» aide les projets de l'initiative à gérer leur flux de données digitales. Car il n'y a souvent pas de solutions toutes faites pour gérer de telles quantités de données.

Les scientifiques sont souvent obligés d'écrire des programmes d'évaluation personnalisés ad hoc pour l'analyse et la gestion de données, et pour gérer le stockage des données elles-mêmes. Cela implique le risque qu'une rupture entraîne des pertes de données. Celles qui restent se retrouvent avec des «évaluations en boîte noire», car la fonction exacte des données est inconnue; ceci peut provoquer des erreurs involontaires.

Rôle et composition de SyBIT

C'est à ce moment que le projet SyBIT entre en jeu, avec son éventail de tâches complexes. L'équipe: 

• aide les groupes de recherche à rassembler les données et les infrastructures informatiques nécessaires, et, quand c'est possible, à planifier des processus automatiques;
• fournit des programmes standardisés et des services de gestion de données;
• «réécrit» certains passages des programmes faits maison là où c'est nécessaire, et les organise en librairies réutilisables; 
• aide les groupes de recherche à configurer leurs algorithmes afin de pouvoir les rendre facilement accessibles à une large communauté scientifique;
• gère la plateforme wiki, les listes d'e-mails et les autres services web utilisés par la communauté;
• offre des cours sur l'usage des différents softwares et services, en collaboration avec des instituts partenaires.